Assim como qualquer procedimento médico, a administração de sedativos pode acarretar efeitos colaterais no paciente. Esses efeitos podem incluir náuseas, vômitos, instabilidade emocional e respostas inesperadas, como agitação e confusão. Embora casos de alergia aos medicamentos sedativos sejam raros, é importante estar ciente dos possíveis riscos.

A sedação também pode levar a uma diminuição significativa da respiração, motivo pelo qual é crucial que procedimentos de sedação moderada ou profunda sejam realizados em um ambiente apropriado, sob a supervisão de um profissional de saúde qualificado. Isso garante uma assistência eficaz e minimiza o risco de complicações respiratórias graves.